Das Akademie-Board ist das zentrale Entscheidungsgremium der AIWG. Es legt unter anderem die Jahresthemen der Akademie fest und entscheidet über verschiedene Wissenschafts- und Transferformate. Das Board versammelt wissenschaftliche und praktische Expertisen zum Islam in Deutschland: Mitglieder sind Vertreter_innen der beteiligten islamisch-theologischen Einrichtungen deutscher Hochschulen, Professor_innen anderer Fächer sowie muslimische Expert_innen, die in verschiedenen gesellschaftlichen Bereichen engagiert sind.
Mitglieder des Boards sind: